Hanna Öberg slutade trea efter en rafflande avslutning där norskan Marte Olsbu Röiseland, Dorothea Wierer och Hanna Öberg gjorde upp om pallplaceringarna i tio kilometer jaktstart.
Inför sista skyttet var trion inne på stadion ungefär samtidigt och Öberg missade ett skott och gick ut 7,4 sekunder bakom duon inför de avslutande 900 metrarna.
Öberg, som startade som sjätte åkare, tog sekund på sekund och såg ut att kunna arbeta ikapp avståndet i den sista uppförsbacken innan upploppet. Men då lade norskan Röiseland och italienskan Wierer in en extra växel och såg till att Öberg slutade trea. 4,7 sekunder bakom vinnaren Marte Olsbu Röiseland som spurtade ner Dorothea Wierer.
– Jag närmade mig lite, men det var inte tillräckligt, säger Hanna Öberg till SVT Sport.
Pallplaceringen i tjeckiska Nove Mesto var Hanna Öbergs första i världscupkarriären. Inför sista skyttet hade hon skjutit fullt vid samtliga tre skyttestationer.
– Det var ett jätteroligt lopp och jag är jättenöjd med min insats, säger Hanna Öberg till SVT Sport.
Lagkamraten Anna Magnusson, som haft en tung start på säsongen, gjorde ett kanonlopp i skuggan av Öbergs VC-succé. Hon korsade mållinjen som 14:e åkare, 1.51,1 bakom vinnaren Röiseland.
Mona Brorsson slutade på tolfte plats. Linn Persson blev 15:e och Emma Nilsson blev 54:a.