Piteå Elit-åkaren Jennie Öberg var 3,70 bakom kvalvinnaren Jonna Sundling från IFK Umeå.
Ytterligare fem åkare från länet tog sig vidare till kvällens finalpass som inleds 18.00 i kväll.
Sävast Ski Team-duon Clara Auland (8) och Lovisa Modig (9) höll sig långt framme i listan. Även Gellivare Skidalliansduon Jenny Larsson (10) och Matilda Jönsson (27) samt Piteås Mia Eriksson (14) tog sig vidare till kvartsfinalen.
I herrprologen som avgjordes 20 minuter senare gick två norrbottningar vidare.
Bäst var Piteås Johan Häggström som kvalade sig vidare som tia. Jens Andersson från Kalix SK blev 22:a.