Cyberattacken, som stoppade hemsidan i cirka 90 minuter, inkluderade en argentinsk flagga och ett provokativt meddelande:
"Anvisa, vi satt inte i karantän innan vi gick över alla era servrar: Ska ni visa ut oss också?".
Det var i söndags som matchen Brasilien–Argentina stoppades efter bara några minuters spel sedan Anvisa-personal stormat planen med anklagelser om att fyra argentinska spelare brutit mot coronareglerna vid inresa till landet.
Brasilien anser att spelarna, Giovani Lo Celso och Cristian Romero från Tottenham och Emiliano Martinez och Emiliano Buendia från Aston Villa, ljugit om att de vistats i Storbritannien inför matchen och att de därför var tvungna att sättas i karantän och inte fick spela.
Sidan som hackades är den med formulär som utländska inresande måste fylla i innan de släpps in i landet.
Det är inte bestämt när VM-kvalmatchen ska spelas.