Mittfältaren stannar i Åtvidaberg som åkte ner till division 1.
Det nya kontraktet är skrivet på ett år och tanken är att Marklund ska få en ledande roll när laget siktar på att gå upp i superettan igen.
Senaste säsongen blev det 17 matcher från start, 9 inhopp och 4 mål i näst högsta serien för Piteåkillen som har Storfors AIK som moderklubb.
"Det känns jättebra att Simon väljer att stanna hos oss trots att han haft erbjudande från andra klubbar. Simon är en stor talang som kommer att utvecklas ännu mer under de kommande åren och vi är glada att han vill vara kvar i det nya ÅFF", skriver klubben på sin hemsida.