Olyckan inträffade vid 15:40 strax söder om Abisko.
Mannen, som var anställd av en entreprenör till Trafikverket, befann sig på tågspåret vid Kaisepakte för att sätta upp stolpar när han av okänd anledning blev påkörd av SJ:s tåg i norrgående riktning.
Enligt polisen hade mannen strax innan kollisionen inte visat några tecken på att ha hört tåget, trots att lokföraren tutat.
Mannen omkom i olyckan och anhöriga har nu underrättats av polis. Det är oklart var han var hemmahörande
Polisen rubricerar händelsen som arbetsplatsolycka och har därför inlett en utredning rörande brott mot arbetsmiljölagen.
- Ja, när det sker en arbetsplatsolycka så blir det automatiskt en utredning kring detta enligt rutinerna, säger Mats Andersson, RLC-befäl för Norrbotten vid polisen.
Tågtrafiken på Malmbanan blev stillastående i närmare fyra timmar i båda riktningarna och passagerarna på olyckståget fick sedan fortsätta resan norrut med buss.