Rekommendationen är fortsatt att de med störst risk för att bli allvarligt sjuka eller dö med covid-19 ska erbjudas vaccination först. I första hand personer i hög ålder och med bakomliggande sjukdomar.
Men undantag får nu göras, enligt ett pressmeddelande på tisdagen.
"På grund av hög vårdbelastning och det pressade läget i delar av den regionala hälso- och sjukvården kan det nu behövas lokala anpassningar", skriver myndigheten.
Folkhälsomyndigheten skriver att regioner till exempel kan behöva tidigarelägga vaccinationer av personal på iva, för att inte riskera att personalen insjuknar med störningar i vården som följd.