Han ersätter överste Fredrik Bergman som nu lämnar sin tjänst.
Carl-Johan Edström har tidigare arbetat som divisionschef samt lokal flygchef. Sedan 1992 är han bosatt i Luleå, han kommer ursprungligen från byn Klutmark i Västerbotten.
– Jag känner en stor glädje och stolthet att få möjligheten att komma tillbaka till mitt hemmaförband som flottiljchef. Det är inspirerande att få vara med att leda och utveckla F 21 mot det vi kommer att ställas inför, säger Carl-Johan Edström.
Chefsbytet äger rum 16 januari då en ceremoni också hålls.