Våldtäkten som mannen misstänks för ska ha skett i en bostad utanför centrala Luleå någon gång under dygnet den 24 maj.
Under tisdagen anhölls mannen i hans frånvaro men kunde gripas dagen efter.
Under fredagen gick extra åklagaren Julia Sjöberg till Luleå tingsrätt för att begära mannen häktad. Åklagaren anser att det finns risk att mannen på fri fot kan begå nya brott men också att det finns risk att mannen på fri fot kan försvåra utredningen.
En annan häktningsgrund är att det för våldtäkt inte är lindrigare straff än fängelse i ett år och sex månader.
Tingsrätten beslutade att häkta mannen som nu är på sannolika skäl misstänka för våldtäkt.
Enligt åklagare Julia Sjöberg har mannen och målsägaren tidigare haft en relation.
Enligt mannens försvarare, advokat Jonas Westerlund, förnekar hans klient brott.
Åtal ska vara väckt inom 14 dagar.