Olyckan skedde inte långt från byn Kuttainen, ett par mil sydost om Karesuando. Skoteråkaren ska enligt räddningstjänsten ha varit i sällskap med en annan person som ringde och larmade strax innan klockan 19.
– Vad vi förstår har han kört in i en sten, säger inre befäl vid räddningstjänsten Bo-Lennart Björklund.
Den skadade transporterades på skoter drygt en och en halv kilometer till väg 99 där ambulanshelikoptern mötte upp. Han flögs sedan till akuten på Gällivare sjukhus.
Mannen är i 20-årsåldern och hemmahörande i Kiruna, meddelade Region Norrbotten i en kommuniké på torsdagsförmiddagen. Skoteråkaren ådrog sig lindriga skador och har förts över till vårdavdelning.