Under vårterminen 2018 genomförde Skolinspektionen tillsyn av Sameskolan i Jokkmokk och konstaterade att det fanns brister. I ett beslut daterat den 13 februari i år konstateras att vissa brister kvarstår och att nya tillkommit. Det handlar bland annat om betygsättningen där beslut om betyg inte har dokumenterats i en betygskatalog samt att undervisande lärare i vissa fall inte signerat satta betyg. Vidare påpekas brister i kvalitetsarbetet i förskola och skola. Dokumenterad uppföljning av resultaten gentemot läroplanens mål saknas i förskolan och uppföljning av kunskapsresultaten saknas i skolan.
Sameskolstyrelsen har till den 31 augusti 2020 på sig att vidta åtgärder.