Kvinnan var anställd på Försvarsmaktens löneavdelning i Boden och misstänktes ha förskingrat drygt 60.000 kronor.
Hon erkände och polisanmäldes.
Ärendet anmäldes till Försvarsmaktens personalansvarsnämnd. Kvinnan riskerade sparken men har nu alltså självmant sagt upp sig från sin anställning.