Det meddelade paret på fredagen i ett gemensamt inlägg på Instagram.
"Det är med ett stor omsorg och omtanke som vi fattat det svåra beslutet att skilja oss" skriver de två.
De skriver också att de haft många fina år tillsammans och nu går vidare med "stor kärlek och respekt för vad vi har skapat tillsammans".
Witherspoon och Toth har en son tillsamman och skriver att han nu är deras främsta prioritet.
Att meddelandet om skilsmässan är äkta har bekräftats av en person som representerar Reese Witherspoon.
Reese Withrespoon var tidigare gift med skådespelaren Ryan Phillippe som hon har två barn med.