Det bredare Topixindexet föll också 2,1 procent.
Senare under dagen flyttar de japanska handlarna fokus till inrikespolitiken, då det styrande LDP-partiet ska utse sin nya ledare, som också blir landets nästa premiärminister efter Yoshihide Suga.
I Hongkong är inte oron lika påtaglig under eftermiddagshandeln, Hang Seng-indexet ligger plus 0,4 procent . Kompositindex i Shanghai backar 1,6 procent.